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求助,做酶的定点突变用什么软件,酶晶体结构未知

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发表于 2015-3-24 15:46:35 | 显示全部楼层 |阅读模式

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如题,要做酶的定点突变,酶结构未知,想通过模拟找出让酶和底物亲和力提高的突变
底物是小分子,但是酶先要和另一个底物结合再和第二个底物结合。。。求解
发表于 2015-3-24 21:54:16 | 显示全部楼层
先对接进一个分子,然后再对接进第二个分子。
发表于 2015-3-25 16:29:17 | 显示全部楼层
第一.模拟木有这么神奇第二.如果要做,需要先对蛋白质进行同源模建,常规的软件类似swiss-model, modeller, yasara这些。
随后,还要做蛋白质和小分子的对接,之后,还要做分子动力学。
此外,一些专门的酶设计软件,如rosetta也能给您提供有益的启发
然后,要做出一个成功的设计,对这些软件参数的设置以及结果的理解的准确性都是很重要的,千万不要奢望随便做做就能得到合理的结果
祝好!
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