pymol wizard>measurement二面角测量始终看不到结果

C15056981927 · 发表于 2015-3-19 00:05:09

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本帖最后由 C15056981927 于 2015-3-19 00:07 编辑

新手，最近刚接触pymol,发现二面角测量时，没能得到distance 和angle 那样显示出来，如图所示，图中表示原子即为点击原子顺序。望各位高手给解释，提供解决办法，图文并茂最好不过！！！谢谢！

川大-灰太狼 · 发表于 2015-3-19 21:14:52

二面角不是 distance和angle是Dihedrals，选择了右边的Dihedrals后就点选4个原子，就会出来二面角。

C15056981927 · 发表于 2015-3-20 08:48:43

川大-灰太狼发表于 2015-3-19 21:14
二面角不是 distance和angle是Dihedrals，选择了右边的Dihedrals后就点选4个原子，就会出来二面角。

...

你好，我选的是二面角，但是选择四个原子的时候,硬是看不到二面角，就像你图中的那样。麻烦你再仔细看下我配图中external GUI 的内容，特别是红色箭头所指，你选四个原子的时候，是怎么操作？还真的是麻烦大神给指导了，最近这个还真用得上。我的是这个版本“This Executable Build integrates and extends Open-Source PyMOL 1.3.”。谢谢！

川大-灰太狼 · 发表于 2015-3-20 10:39:26

C15056981927 发表于 2015-3-20 08:48
你好，我选的是二面角，但是选择四个原子的时候,硬是看不到二面角，就像你图中的那样。麻烦你再仔细看下 ...

估计是因为你的图太混乱了，有cartoon 和 stick，因此在你点选的时候容易误选。
建议：隐藏cartoon，只显示stick or line，再进行点选。

C15056981927 · 发表于 2015-3-20 16:27:30

川大-灰太狼发表于 2015-3-20 10:39
估计是因为你的图太混乱了，有cartoon 和 stick，因此在你点选的时候容易误选。
建议：隐藏cartoon，只显 ...

不着，还是提示“Selector-Error: Malformed selection.”，也不知道哪出问题啦

C15056981927 · 发表于 2015-3-20 16:38:50

川大-灰太狼发表于 2015-3-20 10:39
估计是因为你的图太混乱了，有cartoon 和 stick，因此在你点选的时候容易误选。
建议：隐藏cartoon，只显 ...

你能不能把你在进行这个操作时候，external GUI 窗口截图给我看下，看差别在哪；也劳烦你在仔细看下我的截图，看能不能诊断出啥问题，谢谢！！！

川大-灰太狼 · 发表于 2015-3-20 23:02:24

C15056981927 发表于 2015-3-20 16:38
你能不能把你在进行这个操作时候，external GUI 窗口截图给我看下，看差别在哪；也劳烦你在仔细看下我的 ...

我也不清楚你的这个到底怎么回事，可以下载新的1.7版本的pymol重新安装后试试。

这个是我的pymol的GUI部分。
QQ截图20150320230043.jpg

C15056981927 · 发表于 2015-3-21 23:21:19

川大-灰太狼发表于 2015-3-20 23:02
我也不清楚你的这个到底怎么回事，可以下载新的1.7版本的pymol重新安装后试试。

这个是我的pymol的GUI部 ...

嗯，好嘞，谢谢耐性解答。赞！

C15056981927 · 发表于 2015-3-21 23:56:53

C15056981927 发表于 2015-3-21 23:21
嗯，好嘞，谢谢耐性解答。赞！

google 找到答案啦，谢谢！版本有缺陷。遇到类似问题的可参照解决 http://sourceforge.net/p/pymol/m ... 3uc@mail.gmail.com/

C15056981927 · 发表于 2015-3-21 23:57:15

换高级版本也行

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