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[YASARA] Scene文件和Macro文件的PH值区别

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发表于 2014-12-11 16:54:29 | 显示全部楼层 |阅读模式

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如果在准备.sce文件时调整质子化状态采用的PH,和.mcr文件中设定的PH环境不一致,会出现什么结果呢?以某一个为准,还是按先后顺序,会否打乱体系的合理性。


发表于 2014-12-11 23:13:12 | 显示全部楼层
.sce 文件的准备是为了保存好前处理,比如pH值,蛋白的残基质子化,水盒子大小。如果与.mcr不一致的,则.mcr的处理会按照sce的处理,不会出现问题。
 楼主| 发表于 2014-12-12 01:52:23 | 显示全部楼层
川大-灰太狼 发表于 2014-12-11 23:13
.sce 文件的准备是为了保存好前处理,比如pH值,蛋白的残基质子化,水盒子大小。如果与.mcr不一致的,则.mc ...

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