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[YASARA] YASARA分子对接模拟教程

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发表于 2014-11-10 11:01:37 | 显示全部楼层 |阅读模式

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    应阿里和狼哥的邀请,对于YASARA的分子对接教程进行了制作;YASARA是一款全新的、新手友好型分子模拟软件,其最大的优点之一就是,一键分子对接,对接模块目前支持改进版的AutoDock, AutoDock Vina, FlexX。对接流程简单,易操作,如教程编写中存在一些不足,还望大家指出,同时也希望教程能给您的科研工作带来一定的便利。谢谢!

YASARA分子对接模拟教程.pdf

2.1 MB, 下载次数: 522

售价: 2 金币  [记录]

评分

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发表于 2015-1-3 07:55:09 | 显示全部楼层
版主有空能写一个用yasara的MD来计算对接过程的结合自由能么?单纯对接给出来的都是一个打分,而不是真实的复合物形成的自由能。目前在MD的应用中,有很大一块是用MD来计算绝对的结合自由能用于过滤虚拟筛选中的假阳性结果。如果有这么一份教程,那就完美了:)
发表于 2019-10-29 17:27:02 | 显示全部楼层
各位前辈好,我现在还是小白一枚,我主要想问一下,想要用YASARA这个软件做分子动力学模拟时的电脑配置怎么样呢?谢谢了。
发表于 2020-3-31 11:13:42 | 显示全部楼层
您好,我下载了yasara view, 发现没有simulation这个,免费版本菜单栏里面没有这个吗?
发表于 2014-11-10 11:05:31 | 显示全部楼层
顶顶更健康
发表于 2014-11-10 12:06:47 | 显示全部楼层
可惜偶没买
发表于 2014-11-12 09:07:55 | 显示全部楼层
支持原创:)呵呵
发表于 2014-11-13 21:51:39 | 显示全部楼层
支持  来学习来了
发表于 2015-1-13 16:32:43 | 显示全部楼层
这个软件对接中会考虑小分子本身的电荷吗?
发表于 2015-1-29 17:54:19 | 显示全部楼层
谢谢分享~新手非常需要~
发表于 2015-4-10 12:44:24 | 显示全部楼层
谢谢分享~新手非常需要~
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