生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 4730|回复: 12

[YASARA] YASARA分子对接模拟教程

[复制链接]
发表于 2014-11-10 11:01:37 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
    应阿里和狼哥的邀请,对于YASARA的分子对接教程进行了制作;YASARA是一款全新的、新手友好型分子模拟软件,其最大的优点之一就是,一键分子对接,对接模块目前支持改进版的AutoDock, AutoDock Vina, FlexX。对接流程简单,易操作,如教程编写中存在一些不足,还望大家指出,同时也希望教程能给您的科研工作带来一定的便利。谢谢!

YASARA分子对接模拟教程.pdf

2.1 MB, 下载次数: 413

售价: 2 金币  [记录]

评分

参与人数 1金币 +20 收起 理由
川大-灰太狼 + 20 很给力!

查看全部评分

发表于 2015-1-3 07:55:09 | 显示全部楼层
版主有空能写一个用yasara的MD来计算对接过程的结合自由能么?单纯对接给出来的都是一个打分,而不是真实的复合物形成的自由能。目前在MD的应用中,有很大一块是用MD来计算绝对的结合自由能用于过滤虚拟筛选中的假阳性结果。如果有这么一份教程,那就完美了:)
发表于 2015-1-13 16:32:43 | 显示全部楼层
这个软件对接中会考虑小分子本身的电荷吗?
发表于 2015-10-27 20:50:22 | 显示全部楼层
很好的教程,多谢了{:soso_e113:}
发表于 2014-11-10 11:05:31 | 显示全部楼层
顶顶更健康
发表于 2014-11-10 12:06:47 | 显示全部楼层
可惜偶没买
发表于 2014-11-12 09:07:55 | 显示全部楼层
支持原创:)呵呵
发表于 2014-11-13 21:51:39 | 显示全部楼层
支持  来学习来了
发表于 2015-1-29 17:54:19 | 显示全部楼层
谢谢分享~新手非常需要~
发表于 2015-4-10 12:44:24 | 显示全部楼层
谢谢分享~新手非常需要~
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3

GMT+8, 2019-9-20 22:09 , Processed in 0.145797 second(s), 32 queries .

Powered by Discuz! X3.3

© 2001-2017 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表