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同源建模后如何补全缺失的残基???

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发表于 2014-10-27 18:18:29 | 显示全部楼层 |阅读模式

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我现在有一个蛋白,用swiss-model同源建模之后,发现N端有30多个残基有缺失。想问一下,怎么样能够补全这30多个残基,有开源的软件可以补全残基的功能吗??曾经用UCSF Chimera里面的一个功能补全过残基,发现效果很差。

类似像MD这样的商业软件,我可能用不了,因为我是准备要发文章的,没有买。所以,不知道有没开源的软件可以补全残基的。谢谢!!


发表于 2014-10-27 23:09:43 | 显示全部楼层
缺30多个残基的模型不应该吧,用modeller吧,多模版建模可能能解决你的问题。可能会找到两个模版,其中一个前段匹配很好,另外一个后段匹配很好的
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