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请教,模型B-factor用何种软件计算得到

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发表于 2014-10-21 09:57:30 | 显示全部楼层 |阅读模式

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请教各位前辈,在文献里看到计算模型的软件B-fitter,但下载不了,不知哪位有这款软件。或者对于模型的B-factor还可以利用何种软件分析得到?谢谢!
发表于 2014-12-11 14:54:56 | 显示全部楼层
请问你找到这个软件了吗
发表于 2014-12-16 15:47:12 | 显示全部楼层
gromacs可以g_rmsf -f md_noPBC.xtc -s md.tpr -o rmsf-per-residue.xvg -ox average.pdb -oq bfactors.pdb -res
发表于 2015-1-19 20:32:35 | 显示全部楼层
B-FITTER (http://www.mpi-muelheim.mpg.de/reetz.html).
楼主可以看看这篇文献Iterative saturation mutagenesis (ISM) for rapid
directed evolution of functional enzymes
发表于 2015-1-19 20:34:04 | 显示全部楼层
晕 楼主提问是去年十月份的了  不知道是不是晚了
 楼主| 发表于 2015-3-18 19:06:12 | 显示全部楼层
graper2010 发表于 2015-1-19 20:34
晕 楼主提问是去年十月份的了  不知道是不是晚了

没事,同样谢谢你!我之前也下了这篇文献,但上面的链接无法打开。所以看看有没有别的下载地址,或哪位仁兄有的。
发表于 2015-4-2 15:56:48 | 显示全部楼层
wzp9012 发表于 2015-3-18 19:06
没事,同样谢谢你!我之前也下了这篇文献,但上面的链接无法打开。所以看看有没有别的下载地址,或哪位仁 ...

你打开这个链接了吗?或者还有其它什么方法能计算B-factor?
 楼主| 发表于 2015-4-29 08:55:59 | 显示全部楼层
smileyujun 发表于 2015-4-2 15:56
你打开这个链接了吗?或者还有其它什么方法能计算B-factor?

还是打不开,看论坛里说 貌似 Discovery Studio也可以算,
发表于 2015-4-29 09:33:30 | 显示全部楼层
wzp9012 发表于 2015-4-29 08:55
还是打不开,看论坛里说 貌似 Discovery Studio也可以算,

可以算
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