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[AutoDock&Vina] 关于sdf文件拆分的问题

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发表于 2014-10-8 10:57:36 | 显示全部楼层 |阅读模式

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从drugbank数据库中下载含有四千多个分子的sdf文件。如何将他们拆分成单个单个的文件?
PyRx中的openbabel可以打开,但是没法一次性全部拆分成单个的文件。
各位大神请多多指教。{:soso_e183:}
发表于 2014-10-8 17:03:13 | 显示全部楼层
raccoon,我没用过啊。这种情况,我之前要么是拿openbabel,命令行运行,里面有个-m选项,就是拆分文件的。或者就是写个做文本处理的脚本,在文件的$$$$处截断(sdf文件每个分子以$$$$结尾的),得到的自然就是单个分子文件了。raccoon,我从来没用过啊。
 楼主| 发表于 2014-10-8 10:58:10 | 显示全部楼层
raccoon可以吗?
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