药物设计或药物发现思路

浪模拟 · 发表于 2014-9-21 08:51:45

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师兄手下好几个人，每个人主攻不同的方向和软件，有QSAR，有对接，有药效团等等，还有通路网络什么的我也不懂，学了这么久了，却一直没有上手做实际的东西，大家都是怎么做的？{:soso_e100:}

川大-灰太狼 · 发表于 2014-9-21 19:23:42

药物的发现是偶然的，设计只是说朝着可能的方向前进！且设计是辅助，关键在你自己的知识积累和经验。

浪模拟 · 发表于 2014-9-21 08:52:19

可以谈谈经验，思路...

墨竹晓风 · 发表于 2014-9-21 11:11:12

药物设计或药物发现思路，这个题目太大了。。。还是通过最新的文献吧，毕竟方法太多，难以一一讨论。可以先看看郭宗儒老师编写的一系列书。

dejunchem · 发表于 2014-9-22 09:03:18

药物发现的本身就是寻找具有“较佳活性“的化合物。这活性包括，体内，体外的，代谢的，毒性低的……所以说，药物发现本身就是一个复杂的系统过程。这里没有用”最假“，现实中很难找到最佳。一般的药物发现的过程，包括先导化合物的发现，结构优化，等找到上述化合物。先导化合的发现，常见的包括，天然产物飞筛选，化合库高通量筛选，虚拟筛选后活性验证。结构优化，包括基于蛋白结构的优化，基于小分子本身的优化，这里核心的就是探究构效关系（SAR）。这里面包括很多经验和运气的成分……

dejunchem · 发表于 2014-9-22 09:04:43

另外，要把药物发现和发科研型论文区别……

stone1101 · 发表于 2015-4-28 16:26:50

dejunchem 发表于 2014-9-22 09:03
药物发现的本身就是寻找具有“较佳活性“的化合物。这活性包括，体内，体外的，代谢的，毒性低的……所 ...

我现在模拟筛选出一种类型的物质具有抗炎活性，做结构优化时除了QSAR还有其他方法吗？之前此类结构的物质没有人做生物活性研究，我没有训练集，做不了QSAR.

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