如何通过分子设计，替换氨基酸来提高酶的性能？

shjwu · 发表于 2013-8-5 19:03:56

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老板决定研究酶的结构与功能的关系，具体情况如下：手头上有一个酶，序列已知并已经测定了晶体结构，现在希望通过改变个别氨基酸来提高酶的热稳定性和催化效率，能否通过分子模拟等手段进行设计，决定如何替换或改变氨基酸序列？基本过程和可用的软件是什么？课题马上开始，之前没有经验，现在毫无头绪。希望大侠指个路，谢谢！

大工-阿里巴巴 · 发表于 2013-8-6 21:51:04

热稳定性和催化效率本身就是酶改造的两个热点，你在有了晶体结构之后，做这两方面的设计都是很有优势的了~热稳定性可以通过引入氢键和盐桥以及二硫键去实现，催化效率就更为复杂，你可以考虑从改变底物和酶的亲和能力以及反应速率上来着手，涉及底物进入的通道改造，结合位点氨基酸的改造等等。具体的方法也有很多，最基本的可以从序列比对上着手，去看看决定底物特异性和催化效率的关键氨基酸残基可能是什么，从而加以改造，其次，是综合利用分子对接和分子动力学模拟等手段，去研究不同底物和蛋白质的结合情况，从而有目的性的去改造你的蛋白质。此中道理虽简单，实际操作却是理论和运气的结合。祝君好运！

zhengwei0407 · 发表于 2014-6-12 09:27:50

热稳定性和催化效率本身就是酶改造的两个热点，你在有了晶体结构之后，做这两方面的设计都是很有优势的了~ ...

引入氢键和盐桥以及二硫键要怎么分析，通过什么软件分析呢？

历史的留言 · 发表于 2013-8-6 21:51:00

刘明与马克是对好基友

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