如何进行2条序列或多序列的建模啊？？谢谢

zhangmao511 · 发表于 2014-8-18 23:36:47

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想请教一下大虾，我有2条蛋白序列（我已经知道这2个蛋白相结合成复合体结构），然后我也有它们的模板序列和PDB文件，哪些软件可以对这样的复合体进行建模呢，谢谢！！！SWISS-model尝试了一下，貌似不行，Modeller可以吗？？

zhangmao511 · 发表于 2014-8-26 19:45:33

自己顶一下，Modeller可以吗？？

天理-小新 · 发表于 2014-10-1 16:00:38

如果你的蛋白是同源二聚体，是可以用来建模的，当然dimer也可以的。在建模中要指定距离限制。还有就是，同源建模中无法解决interface interactions。

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