请教问题

junqizhao

我在用Discovery studio 对接酶与底物的过程中，一共4个底物（都已经验证能水解），只有两个能成功用Cdocker对接，而用libdock时，四个底物都能对接，同时，我用模板晶体，已知可以结合四个底物，也不能用Cdocker对接，请问这是什么情况？谢谢

iovvoi

有两种解决方法：
一、如果确定使用CDOCKER的话，可以进行参数的调整，可以将模拟退火的参数调大，方位取向的参数调大，产生更多的构象去进行对接。
二、换对接程序，比如你说的libdock程序，对接程序没有贵贱之分，能解决问题的就是好算法。
希望对你有帮助。