多肽化合物的对接

sunnyboyluan · 发表于 2014-7-28 10:03:54

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大家好，本人初学分子对接，我有一个20个氨基酸组成的多肽，想跟一个酶的底物结合口袋进行一下对接，请问什么软件可以实现？谢谢？还有顺便问一下有没有软件可以画出这个多肽，谢谢

川大-灰太狼 · 发表于 2014-7-28 12:04:59

pymol可以画出多肽，另外chemoffice也可以

天理-小新 · 发表于 2014-8-1 10:30:03

多肽可以用Ambertools命令生成，然后做个动力学获得稳定构象，即可用于对接。对接的程序，我推荐ZDOCK和rosetta。

川大-灰太狼 · 发表于 2014-8-1 15:33:08

小新说得很对，很多工具都可以干这个事情！

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[Rosetta] 多肽化合物的对接