紧急求助Autodock连接小分子的问题，谢谢！

zhangmao511

这个是我用Autodock对接的结果，但是我想让上面那个粉红色的小分子和下面这个绿色的残基连接到一起，怎么弄啊？？
那个粉红色的小分子是乙酰基，绿色的残基是赖氨酸。。赖氨酸上被加上了一个乙酰化基团。。就像一个新的氨基酸一样。。怎么连接啊？
Autodock能做到吗？？还是说应该用别的说明软件？？

川大-灰太狼

这个已经是两个事情了，不是一码事。
Autodock做的是分子对接，而不是残基的乙酰化。如果你想做残基的乙酰化，直接用pymol处理下残基就可以，或者其他分子编辑软件。