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[Discovery Studio] DS2.5 对接后能量计算及保存的问题

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发表于 2014-6-14 20:51:44 | 显示全部楼层 |阅读模式

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我用DS2.5 libdock 做了两个小分子与同个受体之间的对接,想比较一下这两个分子与受体结合能力的强弱,除了打分,还想比较一下小分子-受体之间的能量,如何计算能量?能量越小是不是代表结合的越稳定?

我看到文献中用ligplus 软件做对接的二维分子间相互作用,[img]但一直不知道怎么保存对接的结果?找到结果直接输进去ligplus不会出现小分子.
刚开始用论坛,还没有多少金币,:hand::arm:希望好心人帮助!!!

发表于 2014-8-30 13:59:19 | 显示全部楼层

回帖奖励 +1 金币

除了对接打分之外,你可以计算小分子和受体之间的结合自由能,能值越低,结合越强。
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