请教一下用DS做药效团的结果如何评价啊

robert2005 · 发表于 2014-3-5 11:07:00

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请教一下用DS做药效团的结果
Hypothesis 20
Definition: HBA HBA HBD
Weights: 1.09899 1.09899 1.09899
Tolerances: 1.60 2.20 1.60 2.20 1.60 2.20
totalcost=91.2522 RMS=0.833016 correl=0.572333
Cost components: Error=77.9218 Weight=5.57552 Config=7.75489 Tolerance=0
这个打分里面totalcost值是越打表示模型越好，还是越小表示模型越好啊？看教程里面写的是越大越好，但是看文献里写的越小越好，到底哪个对啊？
file:///c:\users\user\documents\tencent files\372094446\image\2_t4ddvqk56`e%25y%hw{)h.jpg
[img]file:///c:\users\user\documents\tencent files\372094446\image\i[b{5[9`fp9upip2(~{ewas.jpg[/img]

Valar_Morghulis · 发表于 2014-3-5 20:54:57

相关系数是不是有点低啊

Valar_Morghulis · 发表于 2014-3-5 20:56:54

用catalyst 也是accelry公司的做药效团是 Δcost 越大越好

blue_cat · 发表于 2014-3-6 08:26:27

不知道你的cost difference是多少，单就你的RMS和correl，你的这个模型很差

zilvbu · 发表于 2014-3-12 18:26:42

主要看Δcost ，其值越大越好。另外，也可以用活性分子（不是建模的那些）和诱饵分子用来检验，看其富集率大小。

suzie · 发表于 2017-5-16 11:21:30

时间有点久了我最近做药效团 nullcost 和total cost 的差值只有十几，想请问怎么提高这个差值

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