用同源建模对氨基酸突变前后蛋白质结构变化进行分析

aprildenny

蛋白质多处氨基酸突变，我想分析一下突变前后的蛋白质三级结构有无变化，用同源建模的方法怎么做？把两个蛋白质都进行同源建模后怎么分析结构变化？能不能把这两个构建的模型进行重叠来发现非重叠的部分？具体怎么做呢？本人同源建模新手，求高手指点！万分感谢！

大工-阿里巴巴

单纯做同源模建是看不出太大的区别的，你可能需要做分子动力学模拟~

aprildenny

大工-阿里巴巴 发表于 2014-1-15 13:55

                               
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单纯做同源模建是看不出太大的区别的，你可能需要做分子动力学模拟~

C:\Users\maihuan\Desktop\360软件小助手截图20140115150333.jpg那我要不要先同源建模看看，再做分子动力学模拟，我是新手，都要一点一点学。你知道怎么做成如图这样的模型吗？就是一个模型中两个颜色代表不同的蛋白质，可以看到哪里重叠了哪里没重叠。万分感谢！

aprildenny

大工-阿里巴巴 发表于 2014-1-15 13:55

                               
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单纯做同源模建是看不出太大的区别的，你可能需要做分子动力学模拟~

图片怎么上传啊？奇怪，点击图片后输入图片地址，我输入了图片在电脑中的地址竟然不行。

大工-阿里巴巴

aprildenny 发表于 2014-1-15 15:10

                               
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图片怎么上传啊？奇怪，点击图片后输入图片地址，我输入了图片在电脑中的地址竟然不行。 ...

pymol里的align就可以实现这样的功能

川大-灰太狼

aprildenny 发表于 2014-1-15 15:10

                               
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