ligplus的安装与使用（显示配体-受体2维相互作用图）

liuxch5 · 发表于 2012-11-21 23:49:13

liscence要教育网邮箱,可不可以上传一份共享呢

雨枫 · 发表于 2012-11-21 08:51:00

感谢楼主，已成功安装

浙医-中药筛选 · 发表于 2012-11-5 08:20:41

呵呵，非常谢谢。我先去学学PDB文件格式。有问题再来请教。

墨竹晓风 · 发表于 2012-11-4 23:46:12

浙医-中药筛选发表于 2012-11-4 17:29

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To 墨竹晓风. 现有一PDB文件，里面有对接的配体（自己对接上去的），这在DSV3.5下可以看到的。但是在ligp ...

检查PDB文件，首先受体和配体用TER隔开，其次配体的名称不能与残基名称相同

大工-阿里巴巴 · 发表于 2012-11-4 18:30:04

浙医-中药筛选发表于 2012-11-4 17:29

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To 墨竹晓风. 现有一PDB文件，里面有对接的配体（自己对接上去的），这在DSV3.5下可以看到的。但是在ligp ...

把TMP文件夹的设置改在非C盘所在的地方即可！

浙医-中药筛选 · 发表于 2012-11-4 17:29:34

To 墨竹晓风. 现有一PDB文件，里面有对接的配体（自己对接上去的），这在DSV3.5下可以看到的。但是在ligplus通过open---browse打开后，显示无配体。为什么会出现这种情况？这如何处理啊？还有ligplus 还有java都装载c:/program files文件夹里面的。但是每次运行的时候，都出现unable to create log file in tempory directory。但是路径都按教程重新设过的啊。英文帮助看了半天，也没弄清楚。所以来请教

mengguren527 · 发表于 2012-11-3 16:59:06

谢谢楼主分享

墨竹晓风 · 发表于 2012-11-2 22:25:58

天理-小新发表于 2012-11-2 18:52

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给个单独的linux版本吧，谢谢

嗯，如狼哥说的，同样的文件夹，放在Linux下也能用。只要安装了JAVA平台就行。记得改程序路径即可

川大-灰太狼 · 发表于 2012-11-2 21:23:07

天理-小新发表于 2012-11-2 18:52

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给个单独的linux版本吧，谢谢

此程序是Java编写，win和Linux通用的！

天理-小新 · 发表于 2012-11-2 18:52:10

给个单独的linux版本吧，谢谢

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[Ligplot] ligplus的安装与使用（显示配体-受体2维相互作用图）