Ubuntu 14.04 安装amber14, cuda6.5及amber cuda 版本编译

lrf1980

系统是ubuntu14.04, 显卡evga gtx-980
1. 安装gtx980显卡驱动
这个开始搞了很长时间，网上查了很多的相关信息，有人还给出了很复杂的办法，还因为尝试不同方法导致系统出问题，只能重装。
最后在重装好机器后，发现其实没有那么复杂，对ubuntu来说安装gtx-980显卡驱动还是很简单的。在系统的sesytem setting 里面
有一个software & updates，打开这个菜单可以看到各种升级选项，选中additional drivers，等一会儿，系统会显示能找到的显卡驱动
选中nvidia的那个，直接安装就好了。PS。 有网友说在安装nvidia显卡时需要把核显关掉，因为我自己是一直就关了，所以也没有测试
是否不关也照样成功。
2. 安装cuda，首先选择cuda的版本，一个很惨痛的教训就是没有仔细看ambermd.org网站，带来好多麻烦。gtx-980显卡需要cuda-6.5才可以
这个官网上给了详细说明。安装cuda的办法主要参考下面链接的帖子：
http://www.cnblogs.com/platero/p/3993877.html
这个帖子有一个比较有意思的是它先把cuda的安装包解压缩出来，里面包含了三个包。cuda，cuda-samples， nvidia-driver。如果
我们不解压直接安装，对ubuntu来说，好像不那么容易，而且我的尝试也不成功。主要是安装显卡这步容易出问题。所以比较推荐解压缩后安装
一开始时三个包我只装第一个。很顺利，然后安装amber，花了两天的时间卡在升级那里。前面有帖子提到搞定的方法。这里不再复述。
搞定amber升级后，编译安装，先装串行，然后cuda版本，可以很顺利的安装好。但是发现pmemd.cuda不能运行，总是出错 cudadevicecount: unkown error
各种查度娘，信息很少，amber-mail-list里面也有人遇到这个问题，有人还是怀疑cuda没有装好。
所以在琢磨了一下，cuda到底哪里出错了。重新回到上面的帖子
http://www.cnblogs.com/platero/p/3993877.html
里面提到要安装samples，而且安装好后，可以用命令查看cuda是否装好。尝试把samples这个包也安装。然后重新编译一次amber cuda版本。
总算在胆战心惊中搞定

最大的教训就是仔细看说明，仔细看教程。重要的地方看三遍。

wongyouki

lrf1980 发表于 2015-11-4 06:48
显卡驱动装好了么？cuda里面有两部分，一部分是cuda本身，一部分是显卡驱动，利用software update的方法装 ...

admin815@admin815-HP-EliteDesk-800-G1-SFF:~$ lspci
00:00.0 Host bridge: Intel Corporation 4th Gen Core Processor DRAM Controller (rev 06)
00:01.0 PCI bridge: Intel Corporation Xeon E3-1200 v3/4th Gen Core Processor PCI Express x16 Controller (rev 06)
00:02.0 Display controller: Intel Corporation Xeon E3-1200 v3/4th Gen Core Processor Integrated Graphics Controller (rev 06)
00:03.0 Audio device: Intel Corporation Xeon E3-1200 v3/4th Gen Core Processor HD Audio Controller (rev 06)
00:14.0 USB controller: Intel Corporation 8 Series/C220 Series Chipset Family USB xHCI (rev 04)
00:16.0 Communication controller: Intel Corporation 8 Series/C220 Series Chipset Family MEI Controller #1 (rev 04)
00:16.3 Serial controller: Intel Corporation 8 Series/C220 Series Chipset Family KT Controller (rev 04)
00:19.0 Ethernet controller: Intel Corporation Ethernet Connection I217-LM (rev 04)
00:1a.0 USB controller: Intel Corporation 8 Series/C220 Series Chipset Family USB EHCI #2 (rev 04)
00:1b.0 Audio device: Intel Corporation 8 Series/C220 Series Chipset High Definition Audio Controller (rev 04)
00:1d.0 USB controller: Intel Corporation 8 Series/C220 Series Chipset Family USB EHCI #1 (rev 04)
00:1f.0 ISA bridge: Intel Corporation Q87 Express LPC Controller (rev 04)
00:1f.2 SATA controller: Intel Corporation 8 Series/C220 Series Chipset Family 6-port SATA Controller 1 [AHCI mode] (rev 04)
00:1f.3 SMBus: Intel Corporation 8 Series/C220 Series Chipset Family SMBus Controller (rev 04)
01:00.0 VGA compatible controller: Advanced Micro Devices, Inc. [AMD/ATI] Cedar [Radeon HD 7350/8350]这么看对吗，我计算机小白，我看最后一个应该是显卡VGA compatible controller: Advanced Micro Devices, Inc. [AMD/ATI] Cedar [Radeon HD 7350/8350]
但是我当初买电脑时是双显卡，一块集成显卡，一块独立显卡，现在就只能看见一张显卡，不知道为什么
我这个AMD显卡不支持CUDA是吗？我以前用windows系统时我记得有NVDIA的呀

wongyouki

lrf1980 发表于 2015-11-3 13:45
什么系统，怎么装的？我没有遇到这个问题

Ubuntu LTS 14.04， 我用sudo apt-get install CUDA，自动装的，然后修改了.bashrc
我从NVDIA下载了适于ubuntu 14.04的cuda deb文件
命令如下：
sudo dpkg -i cuda-repo-ubuntu1404_7.5-18_amd64.deb
sudo apt-get update
sudo apt-get install cuda
sudo gedit .bashrc
加入 export PATH="$PATH:/usr/local/cuda-7.5/bin"
       export LD_LIBRARY_PATH="$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/cuda-7.5/lib64
试了很多方法都不奏效，又重装系统，重装系统再到这一步还是这样

墨竹晓风

棒，谢谢！能总结得更规范化就好了。

lrf1980

墨竹晓风 发表于 2015-8-14 13:53
棒，谢谢！能总结得更规范化就好了。

还少了什么？ ：）

Ares

可以换cuda 7.0了

kangsgo

CUDA好大~

wongyouki

楼主，我装好了CUDA，可是再次开机，输入密码后却卡在那里，进不了桌面了，您有遇到相同问题吗

lrf1980

wongyouki 发表于 2015-10-30 10:01
楼主，我装好了CUDA，可是再次开机，输入密码后却卡在那里，进不了桌面了，您有遇到相同问题吗 ...

什么系统，怎么装的？我没有遇到这个问题

lrf1980

wongyouki 发表于 2015-11-3 14:44
Ubuntu LTS 14.04， 我用sudo apt-get install CUDA，自动装的，然后修改了.bashrc
我从NVDIA下载了适于ub ...

显卡驱动装好了么？cuda里面有两部分，一部分是cuda本身，一部分是显卡驱动，利用software update的方法装好显卡驱动，然后在装cuda的时候不要装显卡驱动。另外记得装好cuda的时候，也装一下sample那部分。
另外你的显卡是什么型号的？