DS对接前小分子处理出问题（急）

紫苏兰 · 发表于 2013-11-20 19:13:52

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本人课题的一部分需要对小分子进行对接研究。所用软件为DS，画图软件为Arguslab。之前的三肽的对接很正常，之后二肽及五肽无法进行“Prepared Ligand"，总出现以下图片中的字样。后分析原因，发现可能是画图软件的问题。二肽的结构从配体网站下载后，问题已解决。但五肽无法从网站下载，已找过群内热心人帮忙画图，还是无法"Prepared"。哪位大神知道原因，还请指点一二。鄙人将感激不尽。
我用的五肽序列”Pro-Arg-His-Gln-Gly"

iovvoi · 发表于 2014-8-30 22:48:08

prepare protein处理小分子体系的前需要进行结构优化

请使用minimize ligands进行结构优化

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