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[AMBER] 求助! amber16用于跑aMD加速动力学时出现cudaMemcpy GPUBuff

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发表于 2017-4-21 15:03:31 | 显示全部楼层 |阅读模式

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用amber16跑蛋白质的加速动力学,但是cuda加速在跑aMD的时候,出现CudaMemcpy GpuBuffer: Download failed an illegal memory access was ecountered.的报错这是为什么啊?
我输入的aMD的命令:pmed.cuda -O -i amd.in -o amd.out -p a.prmtop -c eq.rst -r amd.rst -x amd.nc 是命令错了吗?
图片是我的报错和in文件
求助大神呀

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发表于 2017-4-28 17:13:36 | 显示全部楼层
GPU是什么型号呢
发表于 2017-5-3 09:42:38 | 显示全部楼层
一般是由于结构不合理,空间临近导致的某个原子速度过大
 楼主| 发表于 2017-5-5 20:37:05 | 显示全部楼层
WLQ 发表于 2017-4-28 17:13
GPU是什么型号呢

用的是1080Ti,我在网上查的是因为GPU的原因,
 楼主| 发表于 2017-5-5 20:38:16 | 显示全部楼层
puzhongji 发表于 2017-5-3 09:42
一般是由于结构不合理,空间临近导致的某个原子速度过大

我最后修改了加速参数就可以了,那这种结构不合理是加速参数设置不合理的原因吗?
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