autodock对接精确性问题

odyssus

进行体外酶分子水平筛选，某系列化合物，母核结构一致，仅取代基不一样，如羟基或甲氧基，激动活性差数倍，老板想使用autodock做对接分析下，结果却是两种化合物对接位置基本一致，能量也差不多，这种结果是说明autodock不适合用于这种化合物结构极类似而活性不同的分析，还是我对接存在问题？谢谢啊