新手求问思路

caas-飞飞 · 发表于 2012-12-3 12:15:41

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我是做禽流感植物疫苗的，选用的抗原蛋白是禽流感血凝素蛋白HA，看了一篇文献是将两种亚型的禽流感的HA通过linker连接起来，构架成一个融合蛋白，然后他用insightII做的同源建模，为的是说明通过linker连接不会影响两个HA各自的结构，也就是各自还保持各自的构象，我也想做一个这样的，不过我想连三个，还想再加一个佐剂，也是用linker连接，那个insightII不是商业软件嘛，有没有什么别的方法也可以达到这样的目的呢？谢谢谢谢啦，各位大侠给个思路，我刚开始接触这方面，很是茫然啊！
附件中是那篇文献，大家看一下吧

北京-构效 · 发表于 2012-12-3 15:09:20

帅哥，这样求估计是求不到的，你可以将不明白的问题列出来，或者将你认为可能的思路写出来，这样倒是有可能

caas-飞飞 · 发表于 2012-12-3 17:51:23

北京-构效发表于 2012-12-3 15:09

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帅哥，这样求估计是求不到的，你可以将不明白的问题列出来，或者将你认为可能的思路写出来，这样倒是有可能 ...

刚开始接触啊，软件什么的看了一堆，就是没有思路啊。本来我是想做同源建模的，但是，HA本身是以三聚体的形式存在的，pdb的模板也都是三聚体的形式，这样好像不能用吧。而且这样靠linker连接起来的蛋白没有合适的模板啊。有没有高人啊，高人啊！

caas-飞飞 · 发表于 2012-12-3 17:52:09

有没有高人啊，高人啊！

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