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[Rosetta] rosetta能用于药物设计吗

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发表于 2015-11-8 13:45:49 | 显示全部楼层 |阅读模式

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请教大家,rosetta能用于药物设计吗?比如小分子与蛋白对接,虚拟筛选,全新药物设计等
发表于 2015-12-21 09:13:12 | 显示全部楼层
当然能啦。。。你去看看david baker实验室的网页,里面用rosetta可以基本可以做所有事。。
发表于 2015-12-23 19:22:58 | 显示全部楼层
rosetta最突出的功能还是在于protein-peptide的对接,对于ligand-protein的对接优势体现在multiple ligands的同时对接。若是单个配体对接,不建议用rosetta。auto-dock和suflex-dock都比较优秀。当然,rosetta也可做其他模拟,如同源模建,能量极小化,loop优化等等。
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