autodock最后run的时候出错误

510王力宏 · 发表于 2015-9-23 10:42:50

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我在运行 run autodock时，会出错误。提示是：too few values read in check grid map'a' 还有error:error in readmap
另外生成的文件也特别小。
求问什么原因呀
谢谢

prince好先森 · 发表于 2015-9-23 12:34:50

在终端试试./autudock -p filemame 你再试试用命令行运行grid和dock 试试

510王力宏 · 发表于 2015-9-25 10:29:02

prince好先森发表于 2015-9-23 12:34
在终端试试./autudock -p filemame 你再试试用命令行运行grid和dock 试试

不好意思，我不太明白什么是终端用命令运行grid 和 dock 怎么运行呢？生成的文件特别小是什么原因啊

prince好先森 · 发表于 2015-9-25 11:54:39

特别小可能是错的，你用vi打开试试，看有没有东西！

510王力宏 · 发表于 2015-9-26 20:31:37

prince好先森发表于 2015-9-25 11:54
特别小可能是错的，你用vi打开试试，看有没有东西！

还是总提示autodock4: too few values read in. Check grid map 'a' ! 。是不是因为我box的大小和位置没有选在活性口袋附近呀。可是我把box选的挺大的都差不多和受体一样大了。是不是也有可能是这个原因？

prince好先森 · 发表于 2015-9-26 21:41:24

一般box能包括你的活性口袋就可以了，你重新再做一遍看哪里出错了！你可以先试试60 60 60 你的小分子质心坐标选对了吗？

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