生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 6565|回复: 5

[AutoDock&Vina] 关于run autogrid(win7)

[复制链接]
发表于 2015-9-18 17:25:13 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
新手一枚。请问在ADT中run autogrid时log filename 那一栏总是空着的,然后gpf文件那一栏是run autogrid后默认有的,但是browse之后还是找不到,明明上一步保存了gpf文件的,从文件夹里可以看到保存的这个文件就是不显示文件扩展名,想请教下到底是哪里出了问题o(╯□╰)o
ps:win7,软件按照帖子上的教程安装的
发表于 2015-9-18 21:12:27 | 显示全部楼层
首先请自己弄清楚这几个文件保存的到底是什么内容,比如log是保存的你做格点计算过程中的记录。 另外,所有文件都必须放在同一个文件夹下面。
 楼主| 发表于 2015-9-22 10:39:03 | 显示全部楼层
川大-灰太狼 发表于 2015-9-18 21:12
首先请自己弄清楚这几个文件保存的到底是什么内容,比如log是保存的你做格点计算过程中的记录。 另外,所有 ...

多谢学长
1、我是最开始就按照您的建议设置了文件的保存文件夹“C:\Users\Administrator\4.2.6”,autodock4、autogrid4、蛋白、配体都在这个文件夹里
2、program---存放autogrid4的文件夹3、parameter---存放格子数据.gpf的文件夹(问题是上一步保存的gpf文件在browse的时候无法识别。另外格子设置的时候我是尽可能的把配体受体都包含在内,这样有问题吗?因为我是看那个教学视频是这样的)
4、log就像您说的鼓捣了半个月了都是卡在这里
发表于 2016-9-1 20:06:35 | 显示全部楼层
本帖最后由 wx_OjGu5TAo 于 2016-9-1 23:45 编辑

windows沒辦法認gpf和dpf檔
所以你要手動修改副檔名

把檔名後面加上.gpf 和.dpf
发表于 2017-1-1 17:14:57 | 显示全部楼层
楼主您好,我也遇到log filename 一栏空着的问题,请问您解决了吗?知道怎么解决吗?
发表于 2017-3-21 14:16:26 | 显示全部楼层
楼主,我也是这个问题,解决了么
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3 )

GMT+8, 2024-11-22 14:05 , Processed in 0.054774 second(s), 19 queries .

Powered by Discuz! X3.4

Copyright © 2001-2020, Tencent Cloud.

快速回复 返回顶部 返回列表