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[AutoDock&Vina] 如何求算自由能?用autodock

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发表于 2015-9-9 13:43:16 | 显示全部楼层 |阅读模式

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看到以前师兄的笔记,计算Estimated free Energy of Binding,有很多不清楚的地方,
但总算了解了Binding Energy 是不大能说明问题的。

哪位大师指点明路,谢谢!
发表于 2015-9-9 19:27:57 | 显示全部楼层
autodock本来就是简单对接,其打分,也就是Estimated free Energy of Binding能说明一定的问题啊。如果严格来讲,即便是MMPBSA算出来的也不靠谱呢!因此不必纠结于此,主要看你怎么用这个结果了,是否有其他的data支撑
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