生物分子模拟论坛

 找回密码
 我想注册

QQ登录

只需一步,快速开始

扫一扫,访问微社区

查看: 3972|回复: 3

[AutoDock&Vina] autodock (win7) Flexible Residues的操作

[复制链接]
发表于 2015-7-9 23:09:23 | 显示全部楼层 |阅读模式

马上注册,结交更多好友,下载更多分子模拟资源。

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?我想注册

x
本帖最后由 kehan777 于 2015-7-9 23:22 编辑

请问:
AutoDock&ADT教程.doc文件中,hsg1两个亚基上被选中的8号ARG氨基酸残基(为了便于观察,将这两个残基按Ball and Stick模型显示(如图0),这个是怎么操作?

ADT菜单:Flexible Residues → Choose Torsions in Currently Selected Residues… 将选中的残基标记为柔性残基并设置可扭转键的数量。在分子显示窗口中分别点击两个残基上CA和CB原子之间的键,使之变成非扭转的(non-rotatable,紫色),这样两个残基中的32个键共有6个是可扭转(rotatable)的(如图2),点击Close关闭对话框:
怎么分别点击两个残基上CA和CB原子之间的键,鼠标只能spin分子窗口(图1),却点击不了,请指教!谢谢!
1.jpg
0.png
2.png
发表于 2015-7-10 08:26:41 | 显示全部楼层
忘了怎么回事了,你重新打开,然后按shift+ 键
 楼主| 发表于 2015-7-12 08:59:19 | 显示全部楼层
未央尊 发表于 2015-7-10 08:26
忘了怎么回事了,你重新打开,然后按shift+ 键

在进行下一步之前,需要 :
PMV菜单:Display → Show/Hide Molecule 显示hsg1分子。
然后再:
ADT菜单:Flexible Residues → Choose Torsions in Currently Selected Residues…
这样就按住shift键点击了,还是谢谢您的提醒!
发表于 2015-8-23 22:24:45 | 显示全部楼层
学习了,很管用。
您需要登录后才可以回帖 登录 | 我想注册

本版积分规则

QQ|分迪科技|小黑屋|手机版|Archiver|生物分子模拟论坛 ( 蜀ICP备14009200号-3 )

GMT+8, 2024-11-23 02:24 , Processed in 0.051654 second(s), 23 queries .

Powered by Discuz! X3.4

Copyright © 2001-2020, Tencent Cloud.

快速回复 返回顶部 返回列表