AutoDock对接后发现小分子与蛋白对接不到一起

Marc · 发表于 2014-11-7 22:28:19

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我用AD对接完后，配体与受体总是结合不到一起，之前设计好的box，可是配体居然不在box里，这是怎么回事？我的qq：463028847。跪求解答，感激不尽！

川大-灰太狼 · 发表于 2014-11-7 23:06:42

请把你的结果以图片形式发出来。

Marc · 发表于 2014-11-8 11:14:30

川大-灰太狼发表于 2014-11-7 23:06
请把你的结果以图片形式发出来。

最终结果，受体配体结合不到一起。

川大-灰太狼 · 发表于 2014-11-8 17:28:11

你的box 定义的时候的图片呢？

Marc · 发表于 2014-11-8 19:24:34

川大-灰太狼发表于 2014-11-8 17:28
你的box 定义的时候的图片呢？

就是这样

川大-灰太狼 · 发表于 2014-11-9 10:04:46

你的分子结果查看的时候你怎么操作的呢？请描述一下你的点击过程。

Marc · 发表于 2014-11-9 11:07:59

analysis,先打开小分子的dlg文件，再打开大分子，结果就是二者不在一起

xiaomi870712 · 发表于 2017-9-14 17:37:17

你好，我现在也遇到了这个问题，请问你最后是怎么解决的？万分感谢

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[AutoDock&Vina] AutoDock对接后发现小分子与蛋白对接不到一起