如何预测配体与受体见的各种作用力

shanshiyan · 发表于 2014-11-7 08:10:20

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已知蛋白与多肽的晶体复合物，怎么预测下他们之间的相互作用以及相互作用位点呢，该用什么软件呢？
不用对接了，根据复合物知道他们结合模式，但是不知道怎么分析这个复合物。求指点呀

fanc232 · 发表于 2014-11-7 08:36:02

我下载的Discovery studio官方发布的免费版界面。安装好载入复合物以后，点击ligand-receptor-interaction类似意思的一个按钮，就会展示软件认为的所有相互作用力。点击作用力的虚线，界面左下方还会显示大致描述。

fanc232 · 发表于 2014-11-7 08:40:50

不过要注意，我印象里，Discovery studio，支持的版本，是windows的32位和64位；linux的只支持64位。

fanc232 · 发表于 2014-11-7 08:45:19

这图片传上去没有？你看看图片是不是你想要的效果

shanshiyan · 发表于 2014-11-7 09:09:44

fanc232 发表于 2014-11-7 08:45
这图片传上去没有？你看看图片是不是你想要的效果

应该是这种模式，这个DS3.0里有这个功能吗？我没有找到

shanshiyan · 发表于 2014-11-7 09:10:49

fanc232 发表于 2014-11-7 08:45
这图片传上去没有？你看看图片是不是你想要的效果

看到了图片了谢谢

shanshiyan · 发表于 2014-11-7 09:13:02

fanc232 发表于 2014-11-7 08:40
不过要注意，我印象里，Discovery studio，支持的版本，是windows的32位和64位；linux的只支持64位。 ...

有免费界面的连接吗谢谢啦

fanc232 · 发表于 2014-11-8 16:33:42

shanshiyan 发表于 2014-11-7 09:13
有免费界面的连接吗谢谢啦

sorry，学校断网刚恢复。就是Discovery软件的官方网址啊，现在图像界面软件已经是免费的啦。

shanshiyan · 发表于 2014-11-10 15:46:05

fanc232 发表于 2014-11-8 16:33
sorry，学校断网刚恢复。就是Discovery软件的官方网址啊，现在图像界面软件已经是免费的啦。 ...

谢谢啦，下载了，果然可以。可是不知道各个颜色的连接都是指什么作用力。。。。

fanc232 · 发表于 2014-11-11 11:48:51

shanshiyan 发表于 2014-11-10 15:46
谢谢啦，下载了，果然可以。可是不知道各个颜色的连接都是指什么作用力。。。。 ...

对不起我居然这么久都没上论坛...鼠标左键单击表示作用力的虚线，就可以展示作用力的类别。

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