酶定点突变后，结构影响功能

puzhongji · 发表于 2014-3-17 16:46:49

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如何确定酶的活性位点？如何选择相关活性位点，进行氨基酸突变，突变为那个氨基酸，选择思路是？突变后如何确定突变酶活性？整个过程用生物信息，分子模拟的思路大概分析解决，不涉及实验，求教各位这样普遍问题的一般解决思路是什么？

墨竹晓风 · 发表于 2014-3-18 09:59:51

只做分子模拟来解释有点困难。我的初步设想是通过突变不同的残基，然后计算底物与蛋白的结合自由能，并查看形成的氢键的变化规律，如果某个残基被突变后，氢键减少，能量降低，说明这个残基有比较重要的作用。但是，突变后确定突变酶活性，这个应该办不到吧。

多斯 · 发表于 2020-6-21 16:31:27

墨竹晓风发表于 2014-3-18 09:59
只做分子模拟来解释有点困难。我的初步设想是通过突变不同的残基，然后计算底物与蛋白的结合自由能，并查看 ...

以实验文章为基础，通过计算来解释酶的活性改变的原因是否可行？

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