开心果 发表于 2013-12-24 20:05:40

关于vina的conf.txt文件问题

又有问题问大家了我在论坛上看到了babyblue 有关conf.txt的编写
config.cgf
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receptor = rec.pdbqt //受体的名称
center_x = -2
center_y = 0            //盒子的质心
center_z = -4
size_x = 30
size_y = 32            //盒子的大小
size_z = 46
exhaustiveness = 20       //计算的复杂度
cpu = 16                     //并行计算
energy_range = 4          //作用能间距等级，这个我到现在也没搞懂
num_modes = 20         //保留构想数目，这个是cluster之后的结果，实际构想可能很多
#######################################################
我不是很懂我的conf.txt文件中，没有
exhaustiveness =   
cpu =                     
energy_range =
就出现了警告 Detected 16 CPUs WARNING: at low exhaustiveness, it may be impossible to utilize all CPUs
想问一下我的conf.txt缺少的那三项如果没写默认值是多少呢？帮帮忙哦！


我的conf.txt中，原来缺少
exhaustiveness=
cpu=
energy_range=
缺少这三项所以出现了警告Detected 16 CPUs WARNING: at low exhaustiveness, it may be impossible to utilize all CPUs
所以想请教一下 我的conf.txt中缺少的这三项参数如果没有写默认值是多少呀！帮帮忙哦！

天理-小新 发表于 2013-12-24 20:31:43

分别是8 ， cpu会自动检测的，如果失败的话就是1， 最后一项就是3

开心果 发表于 2013-12-24 20:51:43

天理-小新 发表于 2013-12-24 20:31 static/image/common/back.gif
分别是8 ， cpu会自动检测的，如果失败的话就是1， 最后一项就是3

哦 谢谢   圣诞快乐:)

墨竹晓风 发表于 2013-12-25 10:38:21

就出现了警告 Detected 16 CPUs WARNING: at low exhaustiveness, it may be impossible to utilize all CPUs。。这个警告没有关系。只是告诉你“你的cpu允许设置更高的exhaustiveness”

开心果 发表于 2013-12-26 10:50:34

墨竹晓风 发表于 2013-12-25 10:38 static/image/common/back.gif
就出现了警告 Detected 16 CPUs WARNING: at low exhaustiveness, it may be impossible to utilize all C ...

:) 谢谢您的帮助！
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