flacon 发表于 2013-12-4 00:41:28

要如何將docking結果存成一個檔

當我用PYRX做完docking後，要如何存成一個檔，也就是用pymol打開後看的到配體在蛋白質上的結果

川大-灰太狼 发表于 2013-12-4 16:06:41

请问你用的是 autodock还是vina对接的呢？

flacon 发表于 2013-12-8 13:05:42

川大-灰太狼 发表于 2013-12-4 16:06 static/image/common/back.gif
请问你用的是 autodock还是vina对接的呢？

我做的是autodock的對接

川大-灰太狼 发表于 2013-12-11 08:56:31

flacon 发表于 2013-12-8 13:05 static/image/common/back.gif
我做的是autodock的對接

Pyrx不能把蛋白和配体存为一个文件，所以你需要自己单独处理，比如把对接后的配体保存为sdf格式，然后用pymol打开蛋白，再导入配体就行了。接着就可以作图了！
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