关于autodock盒子的设置问题
我在做autodock时，想先做个blind dock,但是我把number of points都选到最大126了，还是无法把真个蛋白包进去，这时我修改spacing来增大盒子的体积。增大spacing是不是会降低对接的精度哈？另外我发现盒子不能旋转，只能平动，这样的话我就不能把蛋白直径最大的部分放在盒子的对角线上。 求大神指导如何处理蛋白太大，盒子包不住的问题。只包裹活性位点即可. blind docking的话,用vina做,参数自己写 后就是vina没有126的限制是吗？
页:
[1]