药物设计的同志们学习一下R软件吧!
R开源,且功能强大,易学,有上千个packages可以直接使用。如果您做定量构效关系(当然不限于这个),不妨试试R,它可以做线性回归,非线性回归,以及各种分类操作,机器学习,作图等等。
下载地址:
cran.r-project.org/
其实,我们完全可以使用R来代替excel,spss等软件来完成日常的统计工作,作为非统计专业的学生,极力推荐大伙玩一玩R软件!
这个还真的学习过一阵子……有时间再重新学习下吧 第一次听说这个,有空的时候能够贴份介绍上来? 很好的软件,只不过还没有学呀 用处一定挺大的,好学不?:) SYPHU_me 发表于 2012-10-29 21:38 static/image/common/back.gif
用处一定挺大的,好学不?
好学,我一会上传一些教程! 不知教程在哪?:'( 如果需要建立QSAR模型的话:1)计算分子描述符【数值型或者fingerprint】2)把描述符和活性联系起来。这里就需要使用R了,当然其他软件也可以。
R可以建立的模型很多:svm RFLR NN etc.太多了。
建立模型时候,还涉及:变量选择,模型检查,应用域的定义等等问题。
如果你的模型很好,可以用来做虚拟筛选,在结合receptor-based的筛选,可能对工作有些益处!
关于R的学习,你就看各个packages的manual就可以了,有的还有vignette。google:cran R。就出现了!:lol 教程:google搜索就好了。
比如:
http://manuals.bioinformatics.ucr.edu/home/chemminer
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