liulan_happy 发表于 2013-10-24 12:16:58

怎样在pymol中，将多个PDB文件合并为一个PDB中？

怎样在pymol中，将多个PDB文件合并为一个PDB中？

大工-阿里巴巴 发表于 2013-10-24 12:58:03

在save molecule的时候摁住ctrl，同时选择多个对象即可

liulan_happy 发表于 2013-10-24 14:02:09

谢谢哟，我试了可以的，我还有个问题，我有将近1000个复合物的pdb文件，想把他们保存到一个pdb中，来统计氨基酸残基出现的频率，要一个一个的在pymol打开这1000个分子吗，然后按照你说的选多个对象保存吗？可不可以一次在pymol中全部打开呢，我试了，如果全部选中再打开报错误的。

大工-阿里巴巴 发表于 2013-10-24 14:25:54

liulan_happy 发表于 2013-10-24 14:02 static/image/common/back.gif
谢谢哟，我试了可以的，我还有个问题，我有将近1000个复合物的pdb文件，想把他们保存到一个pdb中，来统计氨 ...

要实现你的目的，为什么需要把这些结构的pdb都保存在一起呢？要统计氨基酸残基出现的频率，即使是最简单的excel都可以实现啊

liulan_happy 发表于 2013-10-24 16:21:44

我知道excel可以统计呀，但是我想如果这1000多个合并到一个Pdb文件里再以文本的格式来统计会快一些吧！所以想问有什么方法把他们合到一个文件里。

liulan_happy 发表于 2013-10-24 16:23:15

{:soso_e181:}

数据挖掘 发表于 2013-10-24 19:29:33

liulan_happy 发表于 2013-10-24 16:21 static/image/common/back.gif
我知道excel可以统计呀，但是我想如果这1000多个合并到一个Pdb文件里再以文本的格式来统计会快一些吧！所以 ...

我给你一个脚本，推荐你去 queen大学 的pymol script 上看看
以及pymol wiki，
利用cat命令也可以把这些蛋白放在一起
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