dmarkfree 发表于 2013-10-22 10:44:30

autodock电荷非整的问题

如图,出现这样的问题,各位大神一般是怎样解决的


天理-小新 发表于 2013-10-22 23:26:31

1、你检查下你的蛋白文件,是不是缺失原子或者残基,如果缺的话,请补上。
2、是否加氢,是否所有极性氢都加上了。
3、你可以根据情况,手动修改电荷,也可以用其它形式电荷。
4、看看这写残基与原子是不是在活性中心,如果不在,可不必管理它

dmarkfree 发表于 2013-10-29 14:51:03

天理-小新 发表于 2013-10-22 23:26 static/image/common/back.gif
1、你检查下你的蛋白文件,是不是缺失原子或者残基,如果缺的话,请补上。
2、是否加氢,是否所有极性氢都 ...

谢谢,我也找到了这个官方论坛的说明,就是你说的这个

韩小寒qqq 发表于 2015-8-21 15:44:57

我也遇到了这样的问题,请问应该怎样解决,看了“天津 小理”的回复还是不知道具体该怎么操作,请求指点,万分感谢!
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