hinry_jay 发表于 2013-9-15 12:31:34

写给做药化(有机合成)的博/硕士


谨以此文与仍在追求自己药学梦的同仁共勉!

先大概介绍下自己,我博士毕业两年有余,专业是药物化学,现在留在毕业的研究所继续工作。从上博士到现在已有5年,对这个专业多多少少有些感触,现与大家一起分享,希望能对正在攻读博/硕士的同学们有所帮助,少走弯路!一家之言,大家选择性接收即可!

1. 做药化的一定要记住:别把自己搞成和公司(药明,保诺,康龙)做外包的人一样,只知道做反应,老板给什么就做什么,完全是一个合成机器。
2. 在设计化合物时,切忌逮着什么就做什么。不能因为你们实验室有这个原料,你就去做这个化合物,这一点,在你写paper的时候肯定有所感触,在化合物设计部分,你总不能如实说你们有这个原料就做这个衍生物吧。在做之前先好好设计设计,使你合成的衍生物最终有益于你讨论构效关系。尽量使设计的衍生物与先导物在结构上只有一处取代基的差异,这样才好讨论SAR。当然了,你实验室有的原料也可以做一做,没准儿就能出一个活性特别好的化合物,但是不能把这个方式当成你合成目标化合物的主线。

如果打算在毕业后继续走科研这条路,我给大家几点建议和意见(大家批判的看就好)
1. 药物化学教科书上的列出已成药的化合物结构,大家可以多看看,增加自己的药性, 熟悉一些药物优势骨架(privileged structures) 。
2. 补强自己生物方面的知识。生物方面的实验你可以不做,但是最好对一些常见的生物实验有所了解,知道这些生物实验都是干嘛的。尤其是和药化相关的,如western, 免疫共沉淀,细胞周期等等。对一些药理方面的基本知识也应该有所了解,如一些常见的信号通路。总之,做药化不能只是局限于做几个有机合成反应。
3. 计算机辅助药物设计方面的技能最好会一些,尤其是虚拟筛选及基于结构的药物分子设计。如果选择继续走科研这条路,你将来肯定需要自己选课题,选课题对于药化专业来说,无外乎就是找到一个比较新的靶点和一个全新结构骨架的先导物。现在药物研发模式已经不再是早期基于表型筛选的模式,你自己要独立,就应该尽量不要和药物筛选的人“合作”,我的意思是,你不能指靠别人先筛出来一个先导物,然后给你改造,这样也不是不可以,但是研究所或是学校不像公司,研究所/学校各个老板之间就好比两个完全独立的公司,相互之间有利益冲突,将来对这个化合物知识产权会有分歧。现在好多药理的都开始自己做合成了,这是一个普遍现象。所以,先导物的发现也得由你自己来完成。现在看来一个比较好的解决方法就是计算机辅助药物设计了,这门技术可以让你从无到有,只需要找做药理的给你筛活性就好了,知识产权完全在你。

4. 坚持一周一篇综述的习惯。这是一个厚积薄发的过程,天下没有白做的学问。大家平时可以去“Nature Review Drug Discovery” 去搜一些感兴趣的review看一看,也可以了解一些药学前言,这对自己将来选项立项,个人觉得是很重要的。

好了,暂时写这么多,有点乱,望大家批判。

hinry_jay 发表于 2013-9-17 11:34:27

qian430 发表于 2013-9-16 16:06 static/image/common/back.gif
毕业的师兄,我有个问题:如果我想每天监测下发表了哪些和我方向相关的文章,最好能看到所有杂志上对这一 ...

药化方面除了综述性的期刊如“Nature Review Drug Discovery ” 及 “Medicinal Research Reviews” 等外,其他的主流杂志主要包括“JMC”, "EJMC" "BMC""BMCL","CMC" "ACS MCL", 好的文章也就再这些期刊上了,不过 jacs 也有药化方面的。 我个人觉得“Nature Review Drug Discovery ” 是首选,这些review都是大牛写的,而且期刊上还有专门介绍其他期刊上发表的有突出贡献的paper!

longjason88 发表于 2016-3-8 21:12:01

新进实验室半年,只会做做反应,文献阅读少,也不会设计:(

江123456 发表于 2016-3-15 21:14:45

提到药理的那段话,很赞同,药理和药化不分家啊

天理-小新 发表于 2013-9-15 19:46:54

{:soso_e179:}

xufund 发表于 2013-9-15 20:56:20

涨之势了:)

枫叶苏 发表于 2013-9-15 21:10:39

不错,有同感。。

中科院-石头 发表于 2013-9-15 22:03:08

很实用

combool 发表于 2013-9-16 09:15:24

楼主经验之谈,很赞!

北京-构效 发表于 2013-9-16 10:06:02

不错,是做过事情的人

hinry_jay 发表于 2013-9-16 10:57:18

北京-构效 发表于 2013-9-16 10:06 static/image/common/back.gif
不错,是做过事情的人

确切的讲,应该是一个碰过壁的人!

yuzhiyaon 发表于 2013-9-16 14:37:30

说得有道理

dejunchem 发表于 2013-9-16 20:34:13

qian430 发表于 2013-9-16 16:06 static/image/common/back.gif
毕业的师兄,我有个问题:如果我想每天监测下发表了哪些和我方向相关的文章,最好能看到所有杂志上对这一 ...

常见的期刊跟住就好,药物好杂志也不多,楼主说的的nature.review,drug. discover 更新周期也挺长的。有时候不一定关注课题内的,课题外的也是扩展视野的好办法。尤其是这个杂志,做药物的很有帮助,很多前言的方向都在这。一些JMC这类的,就天天翻翻,每天跟新2-3篇,看看摘要,看看设计思路。其实也挺快的。
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