小郭0815 发表于 2021-7-20 17:18:15

导入PDB文件一直报错

试着将对接后的pdb文件导入ligplot,但文件一直报错，使用pymol打开pdb文件没有问题。

川大-灰太狼 发表于 2021-7-20 17:29:37

错误信息：原子的坐标文件没有找到，所以让Plot很为难：）

小郭0815 发表于 2021-7-20 17:32:38

川大-灰太狼 发表于 2021-7-20 17:29
错误信息：原子的坐标文件没有找到，所以让Plot很为难：）

原子文件用pymol可以正常打开啊，

川大-灰太狼 发表于 2021-7-21 12:00:45

小郭0815 发表于 2021-7-20 17:32
原子文件用pymol可以正常打开啊，

可以试试去掉氢原子后，用ligplot打开。

川大-灰太狼 发表于 2021-7-21 14:05:43

小郭0815 发表于 2021-7-20 17:32
原子文件用pymol可以正常打开啊，

http://bioms.org/forum.php?mod=viewthread&tid=124&highlight=ligplus   ligplus的安装与使用（显示配体-受体2维相互作用图）或许可以参考。
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