五支折断的箭 发表于 2020-4-12 20:19:47

AntoDock对接结果中的结合能

想向各位前辈请教一下，AntoDock对接结果中的结合能是不是一般为负值，且越小越好呢？如果对接结果的结合能都为正值的话，这代表着什么意思呢？就是AutoDock对接结果的结合能正负代表着什么意思呢？

wx_k1w1kQ50 发表于 2020-4-22 16:37:33

对接结果-结合能反应你两个分子对接结合的可能性，，，负值代表二者更容易结合，正值代表不易结合；简单来说，结合能越小越好，表明这个pose的状态下，这两个分子在自然状态下结合释放能量即更容易结合（当然，需要实验进一步验证）
个人理解，你可以参考一下，，我用DS多一些，但感觉原理是一样的。:handshake

mambo 发表于 2020-4-23 09:11:02

越负越好，最好比-9还小。都是正的说明结合很差
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