wl507586 发表于 2013-1-16 20:40:42

分子对接去除重复分子

我有一个化合物库,准备完成后每一个分子生成很多构象,然后进行对接打分。接着我想把每一个分子保留一个打分最高的,其它的重复分子去掉,请问我应该用什么软件,具体该怎么做呢?请高手指点

blue_cat 发表于 2013-1-17 08:27:44

估计也只有Pipeline pilot可以做了

wl507586 发表于 2013-1-17 13:09:12

我用pipeline的Remove duplicate molecules ,只是去除了重复分子,但是不一定保留的是最佳对接分子构象啊,还应该怎么做呢,需要编个脚本什么的么

川大-灰太狼 发表于 2013-1-17 17:06:15

你整个过程不就是一个分子对接的过程吗?而且还没有AD的LGA算法好!有必要这样做吗?

ts2009 发表于 2013-4-23 09:32:53

编个脚本吧,遇到过同样的问题
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