花生花灭 发表于 2018-3-11 14:13:40

autodock对接成功后,使用write complex导出结果,最后小分子构型出错!

autodock对接成功后,使用write complex导出结果,最后小分子构型出错!以前同样的操作没有出现过错误,不知道是什么情况,求解答!

白杨 发表于 2018-3-22 22:08:15

楼主能顺便截个图说一下具体是怎样的构型出错吗?

花生花灭 发表于 2018-3-23 17:20:26

白杨 发表于 2018-3-22 22:08
楼主能顺便截个图说一下具体是怎样的构型出错吗?

花生花灭 发表于 2018-3-23 17:23:34

@白杨如下图

花生花灭 发表于 2018-3-23 17:24:51

花生花灭 发表于 2018-3-23 17:20


看楼下:lol

白杨 发表于 2018-4-7 23:43:13

花生花灭 发表于 2018-3-23 17:23
@白杨如下图

导出complex前结构有出错吗?试试将分子和蛋白分开导出?

花生花灭 发表于 2018-4-8 15:52:34

在autodock 的Analyze里面看是没有错误。把大分子和蛋白分开导出怎么做?可能教下操作,如果将分子和蛋白分开导出,去取pymol看相互作用呢。

花生花灭 发表于 2018-4-8 15:53:37

白杨 发表于 2018-4-7 23:43
导出complex前结构有出错吗?试试将分子和蛋白分开导出?


在autodock 的Analyze里面看是没有错误。把大分子和蛋白分开导出怎么做?可能教下操作,如果将分子和蛋白分开导出,怎么去pymol看相互作用呢。

乎am艾 发表于 2018-4-20 20:40:33

楼主,你的图片是怎样做出来的?求告知
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