yuanlinchen 发表于 2017-12-11 17:20:11

求助，如何将amber16的mdcrd转换成VMD识别的格式，谢谢

如何将amber16的mdcrd转换成VMD识别的格式，谢谢

半里格 发表于 2017-12-26 11:44:47

直接可以识别啊，载入的时候把文件类型选为amber coordinates with periodic box就可以了

laoman 发表于 2017-12-21 21:01:53

amber16默认的轨迹格式就是vmd能支持的netcdf格式，只要把轨迹的mdcrd后缀改成nc就好了。vmd载入轨迹的时候是这样的：vmd topol.pdb md.nc

邙山的鱼 发表于 2017-12-12 14:52:43

cpptraj 读进去再读出来就可以了
页: [1]
查看完整版本: 求助，如何将amber16的mdcrd转换成VMD识别的格式，谢谢