candice 发表于 2012-12-25 16:01:18

gromacs95 53a6力场问题

大家做膜蛋白有没有用过gromacs96 53a6 力场吗？我怎么用这个力场跑着，酪氨酸的羟基与苯环不在一个平面上 而且色氨酸上的苯环也不是一个平面结构，不知道大家遇到过这种问题没？{:soso_e100:}，准备换个力场用amber99SB或OPLS-AA/L all-atom force field ，但不知道膜的力场参数怎么写？

candice 发表于 2013-1-4 14:23:42

这个问题解决了哦！:)

大工-阿里巴巴 发表于 2013-1-4 16:21:27

candice 发表于 2013-1-4 14:23 static/image/common/back.gif
这个问题解决了哦！

鼓励贴出解决方法，大家共同学习哈！哈哈

墨竹晓风 发表于 2013-1-5 09:36:10

支持分享。。另外AMBER的力场试试amber12SB
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