Alecia 发表于 2016-6-13 21:31:04

怎么将autodock的结果修饰一下

本帖最后由 Alecia 于 2016-6-13 21:33 编辑

亲们，我在用autodock作对接时，遇到的问题有：1、得到的是能量这么高，这样的结果能用吗？2、做出来的图的怎么修饰一下啊，感觉我现在得到的结果图不能直接用在文章里。急用，求各位指导一下！

Alecia 发表于 2016-6-13 21:54:56

autodock能做多聚体蛋白和单蛋白的对接吗？

川大-灰太狼 发表于 2016-6-15 15:25:50

1、得到的结果能量太高，请检查分子的体积与蛋白活性空腔的体积大小是否匹配。
2、可以使用pymol，Yasara view，chmeria、VMD等作图软件进行作图。

川大-灰太狼 发表于 2016-6-15 15:26:12

Alecia 发表于 2016-6-13 21:54
autodock能做多聚体蛋白和单蛋白的对接吗？

autodock目前还不能用于蛋白-蛋白对接。
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