李龙Leon 发表于 2016-6-7 19:13:28

PyMOL新手学习

各位好,我想学习一下PyMOL这个软件,按照教程试了一下,打开了一个蛋白质分子2vl0。在命令栏输入label all, chains之后,出现了如下提示:
Traceback (most recent call last):
File "", line 1, in <module>
    #!/bin/sh
NameError: name 'chains' is not defined
Label: labelled 0 atoms.
请问是怎么回事?希望高手指点一下。谢谢!

川大-灰太狼 发表于 2016-6-8 10:34:33

NameError: name 'chains' is not defined这个提示你 没有chains 这个东西,说明你的命令是错误的,请仔细查看pymol命令格式和各个部分代表的意义。

李龙Leon 发表于 2016-6-8 12:32:30

川大-灰太狼 发表于 2016-6-8 10:34
NameError: name 'chains' is not defined这个提示你 没有chains 这个东西,说明你的命令是错误的,请仔 ...

我是个新手,什么也不懂。我是在完全按照网上下载的学习笔记重复的呀。

李龙Leon 发表于 2016-6-9 13:57:13

川大-灰太狼 发表于 2016-6-8 17:09
给你举个例子吧:label all, A这样的才是标记A链。

那对于一个新的蛋白质并不知道它有几条连,想通过软件标记出所有的链呢?
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