沈淼淼 发表于 2016-5-5 09:33:41

gromacs5.1在服务器上的安装问题

楼主是linux和gromacs双料小白,很不幸要摸索如何在服务器上以普通用户安装gmx-5.1(同时服务器/usr/local/gromacs 已经存在一个4.6版本的GMX)
我在自己的home目录下下载并解压了gmx-5.1

tar xfz gromacs-5.1.2.tar.gzcd gromacs-5.1.2mkdir build
cd buildcmake .. -DCAME_INSTALL_PREFIX=/home/user/xncao/sy/gromacs/gromacs-5.1.2 -DGMX_MPI=ON -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ONmake -jmake install一直到make -j都没有什么问题,如下:$ make -j Built target fftwBuild Built target view_objlib Built target mdrun_objlib[ 98%] Built target libgromacs Built target gmxBuilt target template$
但是make install以后就有如下报错:
$ make install
Built target fftwBuild
[ 98%] Built target libgromacs
Built target template
Built target mdrun_objlib
Built target view_objlib
Built target gmx
Install the project...
-- Install configuration: "Release"
-- Installing: /usr/local/gromacs/share/gromacs/COPYING
CMake Error at cmake_install.cmake:36 (FILE):
file INSTALL cannot copy file
"/home/user/xncao/sy/gromacs/gromacs-5.1.2/COPYING" to
"/usr/local/gromacs/share/gromacs/COPYING".

make: *** Error 1


我试图删除或者手动替换/usr/local/gromacs/share/gromacs目录中的COPYING,但是并没有权限。。。


求问大家:1.我已经使用 -DCAME_INSTALL_PREFIX=/home/user/xncao/sy/gromacs/gromacs-5.1.2 试图修改安装位置了,为什么还是在/usr/local/gromacs/share/gromacs/中安装呢?
2.我应该如何做才能把gmx-5.1.2安装在我home目录下?(或者其他目录下,只要不与4.6冲突,能使用就行)

wangpengfei 发表于 2016-6-26 15:31:57

sudo cmake
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