hjunlzr 发表于 2016-2-23 17:24:46

Autodock分子对接问题请教

要对接的蛋白质含有辅酶磷酸吡哆醛（PLP），首先需要PLP与蛋白质中的lys180残基形成共价键，然后再和底物对接，请教在autodock中该怎样设定使lys与PLP形成共价键？谢谢！

川大-灰太狼 发表于 2016-2-23 23:02:54

autodock无法做这个共价键的对接，这个需要使用其他对接软件进行，比如gold，glide商业软件，免费的roseeta fitted covlentdock，还有一些免费的网站可以进行。
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