秋水若寒 发表于 2015-12-29 21:12:08

YASARA对接过程中提示超过96A,找activesite如何处理

YASARA对接过程中提示:a cell axis is longer than 96A, which may reduce docking accuracy. Consider focusing on the active site.
之后Docking on 2 CPU cores with VINA in progress, 0 of 25 runs completed.

如何解决这个问题?
active site如何设定?

川大-灰太狼 发表于 2015-12-30 20:37:38

把box设置得小些,包裹住活性位点即可。这个只是说当你设置大了,对接的准确度会降低,因为你是进行了大盒子宽范围的活性位点搜索。

hjunlzr 发表于 2017-6-24 22:44:40

怎样才能把box设置得小些

白杨 发表于 2018-7-14 10:41:02

hjunlzr 发表于 2017-6-24 22:44
怎样才能把box设置得小些

保存受体前先设好BOX,然后保存受体文件为sce格式
页: [1]
查看完整版本: YASARA对接过程中提示超过96A,找activesite如何处理