浙医-中药筛选 发表于 2015-11-25 10:10:20

小分子文件in格式

各位大侠，本人准备做中药虚拟筛选，中药小分子库是从ZINC库中Natural Products中下载的，一共有57423个化合物，如图所示，这是一个 .in格式的文件。但本人却不知道如何打开? 我已经用过DSV，openbabel等软件，网上也查了查，还是没有弄懂。请了解的大侠指点指点，这个格式该如何打开？谢谢！

pesticide_ccnu 发表于 2015-11-25 13:53:06

分子 分子库 总体来说都是结构文件 可以用vi或者写字本打开来

pesticide_ccnu 发表于 2015-11-25 13:53:53

分子 分子库 总体来说都是结构文件 可以用vi或者写字本打开来 不过你这个估计是一个下载的脚本 具体的你打开看就知道了

浙医-中药筛选 发表于 2015-11-25 19:28:46

感谢pesticide_ccnu。 这分子库是可以用记事本打开的，里面分别一行一行列着结构式。但是我碰到困难是 这个文件该如何直接转换成化学结构的pdb, sdf，mol等格式，这样可以在DSV，pymol等软件中可以查看? 谢谢

浙医-中药筛选 发表于 2015-12-1 08:35:40

问题解决。下载文件的时候应该是点击图中SDF，或Mol2。则下载.bat 文件。用记事本打开，将里面的下载链接拷贝到迅雷就可以下载了。记事本中下载链接说明如图所示（截取小木虫论坛 http://emuch.net/html/201309/6396400.html）。以上与新手们分享！
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