上官爵 发表于 2015-10-26 11:05:32

底物与酶催化中心的距离测定

    各位前辈大家好，在下刚涉及到分子模拟领域，请问大家做分子模拟时，使用yasara，底物与酶催化中心的距离测定能测出来吗，或者别的模拟软件。求大神指教，不胜感激。:):)

肖云天 发表于 2015-10-27 10:30:42

这个很多软件都可以实现，pymol, DS...

greatzdl 发表于 2015-10-27 12:20:01

就是量距离呗
你看看yasara的用户手册，肯定有

上官爵 发表于 2015-10-29 09:56:31

greatzdl 发表于 2015-10-27 12:20
就是量距离呗
你看看yasara的用户手册，肯定有

你好，问题是量的底物与酶活性中心的距离，底物用什么建模比较好，测量距离时，除了yasara view，还会用到其他模块吗，求前辈指教，不胜感激。:):):)

上官爵 发表于 2015-10-29 10:00:55

肖云天 发表于 2015-10-27 10:30
这个很多软件都可以实现，pymol, DS...

你好，pymol, DS，其中pymol安装了，好像用着不是很方便，我安装的是1.7版本的，麻烦您能给在下一个较详细的操作步骤吗，底物怎样建模比较好，十分感谢，:):):)

肖云天 发表于 2015-11-3 16:51:18

上官爵 发表于 2015-10-29 10:00
你好，pymol, DS，其中pymol安装了，好像用着不是很方便，我安装的是1.7版本的，麻烦您能给在下一个较详 ...

pymol是经典可视化软件呀，作图神器，怎么会不方便呢？:D
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